番茄鍾期間的中斷有以下兩種形式。 第一種是自己造成的“內部中斷”。具體地説，是直覺向心智發出信號，告訴自己去做當前專注活動以外的事情。 第二種是別人造成的“外部中斷”。有人找你詢問或請你幫忙，並且等你答覆。接下來我們看，對於這兩類中斷，．番茄工作法都有相應的處理策略。
這兩個寫通道中有一個定義用來在數據可用時對CPU產生外部中斷，另外一個則不具有通知機制。
外部中斷要搶走你的注意力，而你要保護番茄鍾，將注意力留給所承諾的工作。你承諾在25分鐘內專注幹一項活動。但是，當有人過來談論你喜歡的電視節目，總不能永遠都是同樣的回答：“對不起，我正在番茄鍾裏。待會兒再説？"
你在試圖專心完成一個番茄鍾工作期間，常常會被一些事打斷！但如果想在河流裏生存，就得跟鱷魚搞好關係。簡單粗暴的對待方式，只會讓外部中斷變成煩惱。 外部中斷具有互動*。有人正在等你答覆。他們試圖阻止你畫X，而你需要一個策略來減少中斷。不過，值得再一次強調的是，另外別把番茄工作法當成拒絕幫助同事的理由，它可不是專門給古墓派閉關修煉用的。
外部中斷應當明確可見。如果想要減少中斷，首先得實事求是，弄清所遇到中斷的類型和數量。 每遇到一次外部中斷，就在“今日待辦”表格添上中斷所要求活動的標題。寫下來，不讓它佔腦子，而且確保你會在未來的計劃中把它考慮進去。如果你今天不打算處理這件新增的活動，就把它寫入“活動清單”表格，標上截止時間，以及一個“U”代表“計劃外”。否則就把它寫入“今日待辦”表格下半段的“計劃外緊急”區。 然後在“今日待辦”表格當前活動右邊畫一個減號（一）。最後，增強決心來完成中斷前你正在進行的番茄鍾。
